Перезапуск приложения после адаптации расширения выполняется следующим кодом
Код
{ОбщаяФорма.ирАдаптацияРасширения.Форма(40:ВыполнитьОперацию,6)}:
ЗавершитьРаботуСистемы(, Истина, ирОбщий.ПараметрыЗапускаСеансаТекущиеЛкс() + " /C" + СтрЗаменить(ПараметрЗапуска, "ОткрытьАдаптациюИР", ""));
Я проверил его работу для указанной тобой строки запуска материнского приложения. Результатом выражения на месте параметра ДополнительныеПараметрыКоманднойСтроки стала строка без второго /DEBUG. Ну и вообще видно что последним фрагментом, который я передаю платформе, является параметр запуска (/C).
Скорее всего у тебя в статических пользовательских параметрах клиентского приложения указан некорректный протокол отладки для перезапуска. Подробнее читай тут https://infostart.ru/1c/articles/1732527/