Могу ошибаться, но
ЗапуститьСистему(" /RunModeOrdinaryApplication");
запускает тот же EXE-шник, что запущен на данный момент - то толку ровно ноль.
Посему предложение заменить код команды "ирЗапуститьОбычноеПриложение"
на следующий
Код
#Если ТонкийКлиент или ТолстыйКлиентУправляемоеПриложение Тогда
ПараметрыЗапуска = ирОбщий.ПолучитьПараметрыЗапускаПриложения1СТекущейБазыЛкс(,,,,,,,,Ложь);
ЗапуститьПриложение(КаталогПрограммы() + "1cv8.exe " + ПараметрыЗапуска);
#Иначе
Сообщить("Команда доступна только в толстом клиенте");
#КонецЕсли
Модификаторы взял из справки к ЗапуститьСистему.
