оп... я особо не смотрел что там. странно, автоподключение к фоновым - было активно. а как может быть, что обработка находит ссылку в документе (номенклатура), а запросом в ТЧ такой номенклатуры нет? и скорее всего - это не ошибка обработки, так как типовая замена дублей - тоже находит, я проверил. однако, типовая - сказала, что удалила, и действительно больше не находит.
Я консультирую по своему инструменту. Он должен заменять все ссылки. Чтобы увидеть места ссылок детально, в нем можно нажать ALT+F2 (Открыть ссылающийся объект в редакторе объекта БД и найти в нем ссылку) на строке таблицы "Ссылающиеся объекты" страницы "Правила замены".
Ну и в общем так можно сделать с любым объектом напрямую открыть редактор объекта БД для нужного объекта - найти в нем все места с конкретным значением на странице "Поиск в объекте".