Как я понял, тебя интересует режим обычного приложения (про формы писать менее корректно).
В обычном приложении инициализация сеанса выполняется через расширение события ПриНачалеРаботыСистемы. Открываем расширение ИР и его модуль обычного приложения.
Код
&После("ПриНачалеРаботыСистемы")
Процедура ирПриНачалеРаботыСистемы()
...
Если ПравоДоступа("Использование", Метаданные.Обработки.ирПортативный) Тогда
Обработки.ирПортативный.ПолучитьФорму().Открыть();
КонецЕсли;
КонецПроцедуры
Видим здесь открытие формы обработки ирПортативный. Вот она и показывает это окно с панелью запуска инструментов.